Paul Klees malerier er en sammensmeltning af flere forskellige stilarter som ekspressionisme, surrealisme og mest af alt kubisme. Klee eksperimenterede og undersøgte især farveteori, der også var et område han underviste og holdt foredrag inden for. Paul Klees forelæsninger Schriften zur Form und Gestaltungslehre offentliggjort på engelsk som Paul Klee Notebooks anses for at være ligeså vigtige for moderne kunst som Leonardo da Vincis Afhandling om Moderne Kunst var for renæssancekunsten. Paul Klee underviste også ved den kendte tyske Bauhaus Skole for kunst, design og arkitektur, hvilket er et bevis på kunstnerens alsidighed og videnskabelige tilgang til kunsten.

Paul Klees værker afspejler hans tørre humor og til tider barnlige perspektiv. Samtidig er malerierne fulde af rytme, musikalitet og meget velovervejede farvesammensætninger.